Para el buen despacho de las funciones y atribuciones que tiene encomendadas, la Subdirección de Alcantarillado tiene adscritas y a su cargo las siguientes Secciones:
I. Sección de Alcantarillado Hidalgo;
II. Sección Alcantarillado Juárez;
III. Sección Alcantarillado Reforma;
IV. Sección Alcantarillado Libertad; y V. Sección de Rehabilitación de Tuberías de Drenaje.