En su estructuración interna, el Complejo Médico se organizará de la siguiente forma:
I. Tendrá un Consejo Técnico, como máximo órgano de gobierno.
II. Un Director General como funcionario ejecutivo de la institución.
III. Dos unidades médico-asistenciales: el Nuevo Hospital Civil de Guadalajara y el Hospital de Especialidades; mismas que deberán contar con directores, subdirectores, jefes de división, de departamento y de servicios, así como el personal de apoyo que resulte necesario. a) Para las unidades de Oftalmología y de Oncología se contará con jefes de servicio y las posiciones que fuesen necesarias. b) Para la Unidad Materno-Infantil se contará con un Jefe de División, jefes de departamento y de servicios, así como el personal que sea requerido para su adecuado funcionamiento.
Las unidades señaladas en los incisos a y b de esta fracción dependerán orgánica y funcionalmente de la Dirección del Hospital de Especialidades.
IV. Un Instituto de Investigaciones Biomédicas, el que contará con un Director, un Coordinador de Area, el cuerpo de investigadores y el personal de apoyo necesario.
V. Un Centro Cultural de la Salud, que contará con un Director, coordinadores de área y el personal de apoyo necesario.