La Junta de Gobierno será el órgano máximo de gobierno de la Plataforma y estará integrada por:
I. El Gobernador del Estado o la persona que él designe, quien lo presidirá;
II. Un representante de la Secretaría de Innovación, Ciencia y Tecnología de Jalisco, preferentemente la persona titular de la Dirección competente en materia de Educación Superior, Investigación y Posgrado;
III. Tres representantes del Gobierno del Estado, designados por la persona Titular del Poder Ejecutivo, entre los que se deberá encontrar la persona titular de la Secretaría de la Hacienda Pública;
IV. Tres representantes de los sectores estratégicos del Estado con amplia experiencia académica, profesional o empresarial, designados por el Gobernador;
V. El Titular del órgano interno de control del organismo o un representante de la Contraloría del Estado; y VI. Un Secretario Técnico, que será el Director.
Los integrantes señalados en las fracciones V y VI tendrán derecho a voz, pero no a voto.
Las decisiones serán tomadas por mayoría simple de votos de los integrantes presentes y, en caso de empate, el presidente tendrá voto de calidad.
Por cada integrante propietario de la Junta de Gobierno habrá un suplente, quien será designado por su titular y contará con las mismas facultades que el propietario.
El cargo de integrante de la Junta de Gobierno será honorífico, por lo que no recibirá retribución, emolumento, ni compensación alguna por su desempeño.
Los integrantes de la Junta de Gobierno a los que se refieren las fracciones III, IV y V podrán ser designados para cargos de Dirección en la Plataforma, siempre y cuando sea cuando menos un año después de su separación del cargo que hayan desempeñado en la Junta de Gobierno.