La Junta de Gobierno es el órgano máximo de decisión del Instituto y se integra por:
I. El Titular de la Secretaría de Cultura, quien lo preside;
II. El Director General del Instituto, quien funge como Secretario Técnico de la Junta de Gobierno;
III. El titular de la Secretaría de Educación;
IV. El titular de la Secretaría de la Hacienda Pública;
IV. El titular de la Secretaría de Turismo;
VI. El titular de la Contraloría del Estado;
VII. El titular de la Universidad de Guadalajara;
VIII. El titular del Instituto Nacional de Bellas Artes; y IX. El Presidente de la Comisión de Educación, Cultura y Deporte del Congreso del Estado.
Los titulares de la Junta de Gobierno podrán acreditar un suplente.